彼らが自ら標榜するアフガニスタン・イスラム首長国の統制体制に対し、国際社会は厳しい視線を注ぎ続けている。国際連合安全保障理事会（国連安保理）においても、過激派組織による人権侵害や任意拘束、裁判なしの非合法な処罰といった問題は継続的に議論の対象となってきた。
安保理の監視チームがまとめた内部報告書によると、実効支配地域において合法的な法的手続きを経ない身柄拘束が常態化しており、これが国際社会からの外交的承認を遠ざける最大の要因となっている。国際機関の強い懸念にもかかわらず、現地の権力機構は独自の強権的な法解釈を貫いており、人権擁護を求める国際的な圧力を事実上無視する姿勢を強めている。
