訪問時に最も注意すべきなのが時間帯の選択です。食の駅吉岡の営業時間は基本的に9:00〜19:00（冬季等は変動の可能性あり）となっており、年中無休（年始等の特定日を除く）で営業しています。ただし、目的によって訪れるべき時間帯は大きく分かれます。
限定の希少野菜や目玉の朝採れ農産物を確実に手に入れたい場合は、開店直後の9:00〜10:00がベストです。ただし、土日祝日のこの時間帯は駐車場が最も混み合い、レジ待ちの列が伸びやすい傾向にあります。混雑緩和のため警備員が配置されることもありますが、スムーズに入庫したいなら午前9時前の到着を目指すのが賢明です。
一方、レストランでのランチ利用や、落ち着いてお土産選びを楽しみたい場合は、ピークを外した13:30〜15:00が狙い目です。昼の混雑が引き、駐車場もスムーズに停められるようになります。午後になると一部の人気生鮮野菜は品薄になるものの、加工品やお土産、日持ちする特産品は十分に揃っています。
