事態を重く見た合衆国上院議員ハリソン・シュミット（元アポロ17号宇宙飛行士）らの要請を受け、1979年、司法省法執行援助局（LEAA）から約4万4000ドルの公的資金が投じられ、元FBI捜査官ケネス・ロンメル氏を中心とする本格的な特別調査プロジェクト「オペレーション・アニマル・ミューティレーション」が発足しました。
ロンメル捜査官は、ニューメキシコ州警察や法医学者、獣医師と連携し、通報があった現場へ即座に急行。徹底的な鑑識作業と死体解剖を実施しました。その結果、1980年5月に公開された全297ページに及ぶ公式報告書（通称：ロンメル・レポート）は、世間のオカルト的期待を完全に覆す決定的な事実を突きつけました。
報告書に記録された主な科学的ファクトは次の通りです。
- 全件における超常現象の完全否定：調査対象となった変死事案において、レーザー兵器や麻酔薬、未知の外科器具が使用された証拠は0件であった。
- 死因の特定：大半の家畜は、悪天候（凍死・雷撃）、有毒植物の誤食、クロストリジウム感染症などの病死、あるいは低体温症による「自然死」であった。
- 死後の損壊：死因が発生した後、現場に生息するスカベンジャー（コヨーテ、鳥類、昆虫）が遺体に手を加えた痕跡が顕微鏡レベルで確認された。
つまり、政府や軍、あるいは地球外生命体による組織的犯行を示す証拠は一片も存在せず、「典型的な自然死と、その後に生じる自然界の分解プロセス」が事件の根底にあることが公文書によって証明されたのです。
