プライベートにおいては、2026年6月中旬に婚姻届を提出し、既婚者となっています。お相手は当時フジテレビに勤務していた一般の先輩社員（30代女性）であり、数年間の交際期間を経てゴールインを迎えました。
派手な芸能人同士の結婚ではなく、気心の知れた社内結婚を選んだ点も、堅実な藤井アナらしい選択として話題を呼びました。結婚当時、父であるフミヤさんも息子の新たな門出を温かく祝福し、親しい関係者に喜びを語っていたと伝えられています。
気になる子供の有無について、プライベートに関する詳細な情報は過度に公表されていませんが、家庭を大切にする良き夫・父親としての日々を送っています。公私ともに充実した生活基盤が整ったことが、画面越しに伝わる落ち着きと説得力につながっています。
