三木山森林公園を訪れるにあたり、インターネット上の情報などで一部誤解されやすいポイントについて注意が必要です。
最も多い誤解が、バーベキュー（BBQ）の利用ルールです。敷地内のどこでも自由にコンロを持ち込んでBBQができるわけではありません。バーベキューは所定の「バーベキュー広場」に限定されており、事前予約が必須です。直火は厳禁で、器具の持ち込みやゴミの持ち帰りルールが厳格に定められています。ルール違反は自然保護の観点から厳しく指導されるため、利用規約を事前に確認しておくことが欠かせません。
また、犬連れ（ペット同伴）に関する規定も明確に把握しておく必要があります。園内の散策路はリード（引き綱）を着用していれば同伴可能ですが、ロングリードの過度な伸長やす放し飼いは禁止されています。さらに、「森の文化館」をはじめとする屋内施設へのペットの入場は原則不可（補助犬を除く）となっており、芝生広場の一部などペット立ち入り制限区域も存在します。糞尿の処理など飼い主としてのマナー遵守が強く求められています。
交通アクセス面では、マイカー利用であれば山陽自動車道「三木小野IC」から約15分、「三木東IC」から約10分と極めて良好ですが、公共交通機関を利用する場合は注意が必要です。神戸電鉄粟生線「恵比須駅」または「三木上の丸駅」から路線バスやコミュニティバス（みっきぃバス）が運行されているものの、時間帯によっては本数が限られます。電車とバスを乗り継ぐ場合は、事前に神姫バスの発車時刻表をしっかり確認しておくのが賢明です。
