標高500メートルを超える山上に位置するため、平地よりも気温が約3〜4度低く、四季の移ろいを鮮明に体感できるのが播州清水寺の大きな特長です。
1. 春の桜（見頃：4月上旬〜中旬）
山麓から山上へと続くドライブウェイ沿い境内全域に、ソメイヨシノやヤマザクラが咲き誇ります。平地よりも開花が数日から1週間ほど遅れるため、平野部の見頃を逃した参拝者にとっても絶好の観桜スポットとなります。
2. 初夏のアジサイ（見頃：6月中旬〜7月上旬）
梅雨の時期になると、大講堂周辺や参道沿いに色とりどりのアジサイが咲き競います。山上の霧に包まれた幻想的な境内と雨露に濡れるアジサイのコントラストは、写真愛好家からも高い評価を得ています。
3. 秋の紅葉（見頃：11月上旬〜11月下旬）
播州清水寺が年間で最も華やぐ季節です。モミジやカエデ、イチョウが境内を深紅や黄金色に染め上げます。特に大講堂から根本堂へ続く石段や、山頂展望台からの眺望は圧巻です。期間中は夜間ライトアップが実施される年もあり、昼夜を問わず多くの観光客が訪れます。
