京都大学における飛び級の枠組みを理解するうえで欠かせないのが、能力・実績を多面的に評価する「京都大学特色入試」の存在です。一般選抜のようなペーパーテストの一発勝負とは異なり、高校在学中に打ち立てた圧倒的な探究実績と大学での学びに対する適性が問われます。
医学部医学科の特色入試において課される出願資格は、日本の大学入試の中でも最も過酷な水準に位置しています。出願要件として掲げられる主な要素は以下の通りです。
第一に、国際科学オリンピック（数学、物理、化学、生物学、情報など）における日本代表としての出場やメダル獲得、あるいは各種コンテストでの全国最優秀賞レベルの学術的研究成果です。机上の受験勉強にとどまらず、高校生離れした専門性と研究遂行能力を証明できなければ、出願の土俵にすら立てません。
第二に、書類選考を通過した後に待ち受ける個別学力試験や口頭試問、そして大学入学共通テストにおける極めて高い得点率（概ね85〜90%以上）の確保です。どれほど突出した研究実績があろうとも、医学教育の基礎となる全方位の学力を欠いていれば容赦なく不合格となる仕組みが構築されています。
