旅行スケジュールを組むにあたり、館内の所要時間の目安は重要な判断材料となります。見学スタイルに応じた時間配分の目安は以下の通りです。
- 標準サクッとコース（約2時間）：大回遊水槽や主要展示を巡り、イルカショーを1回観覧するスピード重視のルート。
- じっくり満喫コース（約3時間〜3時間30分）：イルカショーに加え、セイウチのパフォーマンス、あそびーちでの滞在、タッチプール体験まで網羅する王道ルート。
- ファミリー・体験重視コース（4時間以上）：あそびーちでの水遊びや砂遊び、館内レストランでのランチ、お土産選びまでゆったり楽しむフルコース。
大分マリーンパレス水族館の営業時間は基本的に9:00〜17:00（最終入館16:30、GWや夏季繁忙期は延長営業あり）となっています。混雑のピークは11:00〜14:30に集中し、特にこの時間帯は国道10号線からの駐車場入り待ち渋滞が発生しやすくなります。
混雑を完全に回避する裏ワザは、朝一番の9:00〜9:30に入館する「アーリーエントリー」、またはピークアウトした15:00以降に入館する「レイトエントリー」の2択です。朝一番に入館すれば、午前中のメインパフォーマンスを最前列に近い良席で観覧でき、駐車場への入出庫も極めてスムーズに進みます。
