ネット上の情報で散見される誤解のひとつが、「新幹線の乗り場はすべて同じ」という思い込みです。東京駅にはJR東日本（東北・上越・北陸新幹線など）とJR東海（東海道・山陽新幹線）という2つの異なる新幹線システムが並走しています。八重洲南口に直結しているのは東海道山陽新幹線 南のりかえ口および新幹線八重洲南口改札です。
在来線で東京駅に到着し、新幹線へ乗り換える乗客は、一度外に出る改札口ではなく「南のりかえ口」を利用するのが最短動線です。ここを誤って改札外に出てしまうと、再度改札を通る二度手間が生じ、繁忙期には有人窓口や再入場レーンに長蛇の列が生じます。
また、「丸の内の銀の鈴」のように有名な東京駅八重洲南口 待ち合わせ場所の定番がないという悩みもよく耳にします。実用的な待ち合わせスポットとしては、南口改札を出てすぐ左手の「JR高速バスきっぷ売り場前」、または八重洲南口と中央口の間にある広場スペースが視認性に優れています。天候が崩れている場合は、改札正面のエスカレーターを降りた八重洲地下街（ヤエチカ）のメインアベニュー入口を指定するのが賢明な選択です。
