うみがたり水族館の混雑は、時間帯と曜日によって明確なパターンがあります。平日は比較的落ち着いており、特に火曜日から木曜日は団体客の予約が少ない日が多く、「空いている時間」を狙うなら平日の午前中か14時以降が鉄板です。一方、土日祝は開館と同時に家族連れが押し寄せ、11時〜13時にかけて入場ゲートと駐車場の両方がピークに達します。
曜日別では、土曜日よりも日曜日の午後がやや落ち着く傾向があり、連休最終日は午前中から比較的空いています。また、天候も大きく影響し、雨天時は屋内型の展示が充実しているためかえって混雑することがあるため注意が必要です。口コミでも「雨の日は思ったより人が多かった」という声が散見されます。