非常に便利なマイナポータル連携だが、利用時にはいくつか見落としがちな注意点が存在する。まず挙げられるのが、暗証番号のロック問題だ。署名用電子証明書のパスワード（英数字6〜16桁）を5回連続で間違えるとロックがかかり、結局は市役所の窓口まで解除手続きに行かなければならなくなる。
また、転居や婚姻などで氏名や住所に変更が生じた際、マイナンバーカードの券面更新手続きを終えていないとオンライン申請が弾かれる事例もある。トラブルを避けスムーズに終わらせるためには、カードの有効期限や登録情報の最新化をあらかじめ確認しておくことが不可欠だ。
