同院の根底に流れているのは、創立者である高木兼寛が唱えた「病気を診ずして病人を診よ」という不変の理念だ。学校法人東京慈恵会医科大学の歴史は、日本の近代医学の歴史そのものと言っても過言ではない。海軍医総監でもあった高木は、脚気の原因究明と栄養改善に尽力し、患者一人ひとりの生活や背景に寄り添う医療を徹底的に追求した。
高度に専門化・細分化された最先端の医療現場であっても、この「人間愛」に基づく哲学は失われていない。単に疾患の部位だけを切り取って治療するのではなく、患者の人生やQOL（生活の質）を多角的に考慮する姿勢が、長年にわたり多くの人々から絶大な信頼を集め続けている理由である。
