きまぐれゲートの内部は、突入時にランダムで決定される4つの基本タイプと、超低確率で遭遇する特殊空間に分かれています。それぞれの部屋には固有のクリア条件が設定されています。
【たたかいの間】
出現する敵妖怪を全滅させることが条件。制限時間付きの連戦になるケースが多く、全体攻撃必殺技を持つアタッカーがいるとスムーズに突破できます。
【ふしぎの間】
「アイテム使用禁止」「必殺技禁止」「特定の種族のみで戦え」といった特殊な縛りルールが課される部屋。編成の柔軟性が試されます。
【しれんの間】
トラップを避けながらゴールを目指すアクション系や、強敵とのタイマン勝負など、プレイヤースキルが直結する試練が待ち受けます。
【お宝の間】
戦闘がなく、複数の宝箱が並ぶボーナスステージ。金の宝箱からは激レアな合成アイテムや高級コインが入手可能です。
そして、最も注目すべきが超レア空間「きまぐれパーリィー」です。突入した瞬間にきらびやかな演出が入り、大量の高級宝箱と限定妖怪たちが出現します。きまぐれパーリィーは完全な確率依存ですが、USA側のゲートから突入した際の発生率がやや高い傾向にあります。ここでしか手に入らない限定装備「ゲートバッジ」や各種秘伝書はコンプリート必須の報酬です。