学習者や一般読者が最も混乱しやすいのが、「炭素原子（C）を含んでいるにもかかわらず無機物に分類される物質」の存在です。化学の国際基準（IUPAC等）や教育現場では、以下の物質群を慣習的・構造的な理由から無機物として定義しています。
1. 炭素の単体（同素体）
ダイヤモンド、黒鉛（グラファイト）、フラーレン、カーボンナノチューブなどは炭素原子100%で構成されていますが、化合物ではないため無機物に分類されます。
2. ごく単純な炭素酸化物
二酸化炭素（CO₂）や一酸化炭素（CO）は、炭素と酸素の単純な結合体であり、有機物特有の複雑な炭素鎖構造を持たないため無機物に属します。
3. 炭酸塩および炭酸水素塩
貝殻や石灰石の主成分である炭酸カルシウム（CaCO₃）、重曹として知られる炭酸水素ナトリウム（NaHCO₃）などは、鉱物的な性質が強く、無機化合物として扱われます。
4. シアン化物・炭化物
シアン化カリウム（青酸カリ、KCN）や炭化カルシウム（CaC₂）なども無機物の範疇に入ります。「炭素があればすべて有機物」と短絡的に覚えていると、テストや実務の判定で確実に罠にはまります。
