作中で「僕のヴィランアカデミア」と銘打たれたエピソードは、原作漫画の単行本第23巻（第220話）から第25巻（第240話）にかけて展開された「異能解放軍編」を指します。当時、週刊少年ジャンプ本誌の連載を開いた読者を驚愕させたのは、目次や作品ロゴが『僕のヒーローアカデミア』から『僕のヴィランアカデミア』へと大胆に書き換えられていた仕掛けでした。主人公である緑谷出久（デク）たち雄英高校の生徒が一切登場せず、死柄木弔率いるヴィラン連合の結成秘話、貧困、葛藤、そして覚醒のみが数ヶ月にわたって描かれる異例の構成が取られたのです。
このメタフィクション的なタイトル乗っ取りは、アニメ第5期（第108話〜第112話）でも忠実に再現されました。オープニング映像やテーマ曲の演出、劇中のアイキャッチ、次回予告のナレーションに至るまで敵連合のメンバーが乗っ取り、制作スタジオ・ボンズの並々ならぬこだわりが大きな話題を呼びました。単なるサブプロットではなく、敵側の「歪んだオリジンと成長物語」を主役に据えることで、善悪の境界線を揺るがすヒロアカ屈指のハイライトとして評価されています。
