フェリー乗船にあたり、一般の徒歩客（旅客のみ）は事前の予約が一切不要です。当日に各港の自動券売機や窓口で乗船券を購入し、そのまま改札列に並ぶシステムとなっています。
マイカーやレンタカーを載せる直島フェリーの車両航送についても、基本的に事前予約は受け付けておらず、当日の先着順で車列に並ぶ運用が採られています。乗船手続き時には車検証の提示が必要となるため、あらかじめダッシュボードから出しておくと手続きが円滑です。
注意点として、直島島内は道幅が非常に狭く、主要な美術館周辺は一般車両の進入禁止エリアや駐車場の台数制限が厳しく設定されています。そのため、特別な事情がない限り車を島へ持ち込むのは避け、各港の周辺駐車場に車を停めて徒歩で渡航し、島内では町営バスや電動アシスト付きレンタサイクルを活用するのが現地でのスマートな移動方法です。
