京都府警をはじめとする捜査当局は、延べ数万人規模の捜査員を投入し、現場周辺のしらみつぶしな聞き込みや防犯カメラ映像の解析を行ってきました。
捜査の初期段階では、近隣の不審者情報や過去の性犯罪前科者の洗い出し、さらには通学路に接続する幹線道路を通過した車両の割り出しなど、多角的なアプローチが取られました。それでもなお事件が未解決のまま推移している背景には、当時の防犯カメラ設置台数の少なさと、Nシステム（自動車ナンバー自動読取装置）の死角を突かれた可能性が指摘されています。
目撃者の証言内容に時間的なズレが生じていたことや、現場周辺に点在する入り組んだ路地が逃走経路の特定を困難にさせました。警察は現在も重要未解決事件として指定し、専従捜査班による情報の再精査を続けています。
