皮膚科学の見地から言えば、同じ場所にできるニキビの決定的な理由は、炎症が沈静化した後も皮膚深部に病変の「根」が残存している点にあります。肉眼では赤みが引き、平らになったように見えても、毛包の奥深くでは微小面皰（マイクロコメド）と呼ばれる毛穴の詰まりが解消されておらず、皮脂が再充填される準備が整ったまま放置されているケースが全体の約70%以上を占めます。
さらに深刻なのが、同じ毛穴にニキビが何度もできる経緯において発生する「毛包壁の菲薄化（ひはくか）と断裂」です。強い炎症を起こしたニキビは、毛穴の壁組織を溶かして破壊します。修復される過程で毛包の形状がいびつに歪み、硬い瘢痕（はんこん）組織で囲まれると、本来なら自然に排出されるべき皮脂や角質が物理的に滞留しやすい「ポケット構造」が完成してしまいます。この歪んだポケットこそが、アクネ菌が好む嫌気性環境の温床となり、わずかな皮脂分泌の増加でも即座に炎症を再燃させる元凶です。
