事故直後、ボートを操縦していた東京都中央区の会社役員・佐藤剛被告は、救助活動を行うこともなく現場を立ち去った。事件発覚当初、被告は「自分は誰にもぶつかっていない」「木片か何かの浮遊物に当たったと思っていた」と供述し、事故への関与そのものを全面的に否認し続けた。
事態を重く見た福島県警察は海上保安庁と連携し、異例の大規模捜査本部を設置した。東京の保管施設にあった容疑船を押収し、船底やプロペラに付着した微細な塗料片、生体痕跡を徹底的に科学鑑定。さらに現場周辺にいた他のボート利用者の目撃証言、GPS航跡データ、音響データの精密な解析を積み重ね、1年以上の歳月をかけて佐藤被告を業務上過失致死傷罪で逮捕・起訴へと追い込んだ。
