鑑賞後の満足感を大きく底上げするのが、エントランスフロアにあるミュージアムショップで展開される松本市美術館 限定グッズです。SNSやレビューサイトでも「これを目当てに松本まで来た」という声が多数寄せられています。
特に評判を集めているのが、松本限定デザインのドット柄手ぬぐいやマスキングテープ、キーリング、ピンバッジといった小物類です。草間作品の色彩を忠実に再現した公式グッズは品切れになることも多く、入荷状況によっては「お一人様〇点まで」という個数制限が設けられるほどの人気を博しています。地元松本の老舗とコラボレーションした限定菓子も、デザイン性の高いパッケージからお土産として絶大な支持を得ています。
また、館内中庭の緑を望むカフェでは、信州産の食材を取り入れたランチやアート鑑賞の余韻に浸れるスイーツ、オリジナルドリンクを提供。全面ガラス張りの開放的な空間設計となっており、歩き疲れた身体を休めながら展示の感想を語り合う場として極めて機能的な空間に仕上がっています。