新屋島水族館のもう一つの大きな誇りが、日本国内では沖縄の美ら海水族館と同館の2カ所でしか飼育されていない絶滅危惧種「アメリカマナティ」の存在です。人魚のモデルとも言われるマナティの「じゅんと」「みらい」が、大きな体でのんびりと泳ぎ、器用に前脚を使って白菜やレタスを食べる愛らしい姿は、訪れる人々の心を鷲掴みにしています。
さらに、館内では距離の近さを生かした海獣・小動物の展示が充実しています。
- ゼニガタアザラシ・ゴマフアザラシ：傘を前脚で器用に持つ特技や、プールの縁から顔をひょっこり出して来館者を見つめる姿が名物。
- コツメカワウソ：活発に動き回る様子を間近で観察でき、時間限定の「ごはんタイム」では手渡しでエサを食べる愛嬌たっぷりの仕草を披露。
- ウミガメ・ペンギン：透明度の高い水槽で優雅に泳ぐ姿を見られるだけでなく、エサやり体験イベントも定期開催。
大型水族館のような巨大水槽はありませんが、生き物たちとの物理的・心理的な距離の近さにおいては全国でも指折りの満足度を誇ります。
