『Dr.STONE』の物語は、文明が崩壊したストーンワールドにおける思想と技術のぶつかり合いによって加速します。物語の鍵を握る主要勢力とキーパーソンの立ち位置を整理しました。
石神千空（CV：小林裕介）率いる「科学王国」は、科学の力で全人類78億人を救うことを理念に掲げています。幼馴染の大木大樹（CV：古川慎）や小川杠（CV：市ノ瀬加那）、石神村の熱血科学使いクロム（CV：佐藤元）、高い身体能力を誇るコハク（CV：沼倉愛美）らが初期の基盤を築きました。
対する「司帝国」は、純粋な若者だけの理想郷を目指した獅子王司（CV：中村悠一）が率いた勢力です。武力による専制を敷いたものの、千空との激闘と和解を経て、科学王国と合流することになります。
物語が世界へと広がる航海編・アメリカ編では、元NASAの科学者Dr.ゼノ（CV：野島健児）と、冷徹な軍人スタンリー・スナイダー（CV：遊佐浩二）率いるアメリカチームが登場。千空たちと熾烈な科学・軍事の知恵比べを展開し、やがて全人類の謎である「ホワイマン」の正体に迫る巨大な連合へと発展していきます。
