参拝の証として授かりたい御朱印や授与品も、伊奈波神社ならではの魅力に満ちています。
御朱印は本殿でいただける本社の墨書に加え、境内社である「黒龍神社」の力強い龍の印が押された御朱印が絶大な人気を誇ります。また、毎月最終金曜日の「プレミアムフライデー」には金文字の限定御朱印が授与されるほか、美濃和紙の伝統工芸を活かしたオリジナル限定御朱印帳（黒龍の刺繍が施されたデザインなど）は、遠方から買い求めに訪れる愛好家が後を絶ちません。
授与所には多彩なお守りが並びます。特に注目なのが以下の授与品です。
- 黒龍福守・龍頭守り：黒龍社のご神徳を宿し、起死回生や厄難消除、勝負運向上をもたらす最強のお守り。
- 逆転合格・勝守：五十瓊敷入彦命の武勇にあやかる勝運守り。
- しあわせ守り：ちりめん生地で仕立てられた可愛らしい厄除開運守。
1年間お世話になった古いお札やお守りは、楼門近くに設置されている「古札納所」へ感謝の気持ちを込めて返納しましょう。他社のお札も原則として納めることができますが、人形や仏具、陶器類などは受付不可となっているためルールを守った返納が大切です。
