館内には生き物たちとダイレクトに触れ合える体験型スポットが充実しています。なかでも新館の目玉となっているのが、屋外プールで暮らすウミガメたちを間近で観察できるコーナーです。定時に開催されるウミガメへの餌やり体験では、大きな体を揺らしながら水面に顔を出す愛らしい姿を至近距離で楽しめます。
また、子どもから大人まで夢中になるのが、五感を使って学べるタッチプールとじゃぶじゃぶ川です。サメやエイの背中にそっと触れて感触を確かめたり、手を入れると寄ってくるドクターフィッシュ（ガラ・ルファ）のくすぐったい刺激を体感したりと、日常では味わえない貴重なひとときを過ごせます。
さらに、ゆらゆらと漂うミズクラゲの幻想的な水槽や、特別天然記念物であるオオサンショウウオの迫力ある展示など、写真映えする見どころが各所に散りばめられています。
