岡田斗司夫の結婚歴を振り返ると、過去に一度の婚姻歴があります。ガイナックス立ち上げ前の大阪時代に出会った一般女性(和美さん)と結婚し、長女をもうけました。
しかし、2002年頃に正式に離婚が成立しています。離婚の理由について岡田斗司夫は、自身の極端な仕事優先主義や独自の生活リズム、自由な生き方を追求した結果であることを明かしています。家庭という枠組みに収まることが難しかった点が大きな要因とされています。
特筆すべきは、離婚後も元妻との関係が破綻していない点です。元妻は岡田斗司夫の著作の管理や関連会社の役員を務めるなど、ビジネス上の最重要パートナーとして長年支え続けました。男女の夫婦関係を解消し、互いの才能と役割を尊重する「同志」としての信頼関係を再構築した稀有な例といえます。