2014年8月5日早朝、神戸市中央区の先端医療センタービル内で命を絶った笹井芳樹氏のそばには、複数の遺書が残されていました。発見された封筒は、研究室の秘書机や手提げバッグの中から見つかり、宛先は小保方晴子研究ユニットリーダー（当時）、竹市雅俊CDBセンター長をはじめとする理研幹部、そして自身の家族宛てでした。
小保方晴子氏宛ての遺書には、責任を背負い込まないよう気遣う言葉とともに、研究の未来を託す切実な願いが綴られていました。報道各社によって報じられた主な文面は以下の通りです。
「あなたのせいではありません」
「STAP細胞を必ず再現してください」
「精神的な疲弊で限界に達しました。新しい人生を歩んでください」
笹井芳樹氏が遺した遺書の全文が公的機関から一括公開されたわけではありませんが、リークや関係者の証言を通じて明らかになった内容は、騒動の渦中で孤立していた小保方氏を最後まで庇い、励まそうとする指導者としての姿勢でした。
一方、理研幹部や同僚に宛てたメッセージには、「私の力不足をお詫びします」「これ以上のプレッシャーには耐えられない」といった、限界を超えた精神的苦痛と組織への謝罪が色濃く記されていました。さらに、家族に宛てた手紙には、突然の別れに対する深い謝罪と感謝の念が残されていたと伝えられています。
