ネットの掲示板やSNSで頻繁に議論されるのが、「二重幅を広げたのではないか」「鼻筋を通す整形（鼻尖形成など）をしたのではないか」という疑惑です。昔の映像と現在の高画質な画面を比較すると、確かに目元のぱっちり感や鼻筋の立体感は格段にアップしています。
しかし、こうした疑惑に対して指原さん本人はバラエティ番組や自身のYouTubeチャンネルで「切ったり縫ったりするような大掛かりな整形はしていない」と明確に否定しています。二重幅については、その日のむくみ具合やメイク時のアイテープ・アイプチの工夫、まつ毛の立ち上げ方による見え方の違いを解説。鼻に関しても、コントゥアリング（シェーディングとハイライト）の技術を駆使して高く見せていると明かしています。
一方で、ヒアルロン酸注入やボトックス、ハイフ（HIFU）といった切らない美容医療・肌メンテナンスについては隠すことなくオープンに語っています。「痛い思いをしてメンテナンスしている」と包み隠さず発信する誠実なスタンスが、疑惑を単なるゴシップで終わらせず、実用的な美容情報として信頼される要因となっています。
