近江町市場の一般的な営業時間は朝9時頃から夕方17時頃までとなっていますが、店舗によってオープン時間は大きく異なります。特にランチタイムの11時半から13時半頃にかけては、どの人気店も1〜2時間待ちの行列ができるため、旅のスケジュールを崩さないための工夫が求められます。
混雑を回避する最大の秘訣は、朝7時〜8時台の早朝営業を狙った「市場モーニング」の活用です。早朝から営業している海鮮丼店や寿司店では、オープン直後であれば並ばずにスムーズに入店できるケースが多く、獲れたての新鮮な魚を朝食として贅沢に味わえます。朝の澄んだ空気の中で市場が動き出す様子を見学できるのも、早起きならではの特権です。
昼以降に訪れる場合は、ピークを過ぎた14時以降の遅めランチが穴場の時間帯です。また、市場全体として水曜日と日曜日に休業する鮮魚店が多いため注意してください。飲食店自体は営業している店舗も多いものの、市場全体の活気や買い物を楽しみたい場合は、月・火・木・金・土曜日の午前中に訪れるのが理想的です。