交差点名やバス停の名前として定着している「百万遍」ですが、実は正式な行政地名ではありません。その名称のルーツは、交差点の北東に威風堂々と佇む大本山「百萬遍知恩寺」にあります。
元弘元年（1331年）、京都で大規模な疫病（疫瘡）が猛威を振るいました。この危機に際し、後醍醐天皇の勅命を受けた知恩寺の第八世・善阿空円（ぜんあくうえん）上人が、門弟を率いて7日間にわたり「念仏を100万回唱える（百万遍念仏）」という大法要を執り行いました。その満願の日に疫病が見事に鎮静化した功績を称えられ、後醍醐天皇から「百萬遍」の寺号と大念珠を下賜されたことが、この地が百万遍と呼ばれるようになった決定的な理由です。
境内には現在も巨大な数珠を参拝者全員で回す「大数珠繰り」の伝統が受け継がれており、歴史の重みと人々の平穏への祈りが街の根底に今なお息づいています。
