ECヴィトーリアを語る上で欠かせないのが、世界的な名手を次々と世に送り出してきたアカデミー（下部組織）の圧倒的な育成力です。ブラジル代表の歴史に名を刻む錚々たる顔ぶれが、この赤黒のユニフォームを着てプロのキャリアを踏み出しました。
歴代のECヴィトーリア ユース出身選手・レジェンドの筆頭として挙げられるのが、1994年アメリカW杯優勝メンバーでありセレソンの名FWベベットです。さらに、ミランなどで世界最高峰のGKとして君臨したジーダ、チェルシーやPSGで欧州を制覇した屈強なセンターバックのダビド・ルイス、超人的なフィジカルと左足のキャノンシュートで世界を震撼させたフッキもヴィトーリアの育成組織で磨かれたタレントです。
ほかにも、名MFヴァンペッタやアーセナルで活躍したガブリエル・パウリスタなど、守備陣から攻撃陣に至るまで最高品質のプレーヤーを欧州トップリーグへ輩出し続けています。育成組織「トカ・ド・レオン（ライオンの巣窟）」と呼ばれるトレーニングセンターでは、現在も次世代のブラジル代表を担う有望株が日々鎬を削っています。
