承久3(1221)年の承久の乱においても、義村の決断が歴史の針を大きく動かした。後鳥羽上皇から北条義時追討の官宣旨が出された際、朝廷側は義村の弟である胤義を通じて義村を幕府から寝返らせようと企てた。京都の胤義から届いた密書を前に、義村の選択が幕府の命運を握ることとなった。
義村は躊躇することなく、その密書を直ちに義時へ提出した。朝廷への恭順ではなく、鎌倉幕府の武家政権としての圧倒的な優位性を見抜いていたからである。この迅速な対応が北条方の勝利を決定づけ、承久の乱後における三浦氏の地位をよりいっそう強固なものとした。