非常に優れものである一方、服用するにあたって理解しておくべき注意点も存在する。乾燥酵母は細胞分裂が盛んな素材であるため、必然的に「プリン体」が含まれている。一般的な食事量と比べれば極端に多いわけではないが、尿酸値が高めの人や痛風の既往歴がある人は、事前に医師や薬剤師に相談するのが賢明だ。
また、エビオス錠の基本用量は「1回10錠、1日3回（計30錠）」と非常に多い。最初は飲む大変さに驚く人も少なくないが、これは合成ビタミンなどを凝縮した化学薬品ではなく、天然素材をそのまま固めた指定医薬部外品だからこその特徴である。胃腸への刺激が少ない反面、体質によっては飲み始めにお腹が張ったり便が緩くなったりすることもあるため、少量から慣らしていく方法も有効だ。
