利便性の高い三島新幹線口店ですが、利用計画を立てる上で見落としがちな盲点がいくつか存在します。その筆頭が三島駅レンタカー乗り捨て料金（ワンウェイシステム）のルール設計です。
静岡県東部エリア内の同エリア設定（例えば沼津駅や御殿場駅など一部の近隣店舗間）であれば乗り捨て手数料が無料または低額に設定されているケースが多い一方、伊豆半島最南端の「伊豆急下田駅前」や、神奈川県側の「小田原駅」「箱根湯本」、あるいは羽田空港・東京駅方面へ乗り捨てる場合は、規定のワンウェイ料金（数千円〜1万円超）が加算されます。「三島から下田まで南下して帰りは特急踊り子号で帰る」という片道ドライブプランを組む際は、トータルコストの事前試算が不可欠です。
もう一つの注意点が三島レンタカー当日予約のハードルです。三島駅新幹線口店は県内屈指の稼働率を誇るフラッグシップ店舗であるため、週末や行楽シーズンは数日前から満車状態になることが珍しくありません。当日の飛び込み利用では希望の車種が選べない、あるいは全車貸出中となるリスクがあるため、旅行日程が確定した段階でトヨタレンタカー三島新幹線口店 予約を完了させておくのが賢明です。
