妊娠が成立すると、卵巣にある黄体から黄体ホルモン（プロゲステロン）が大量に分泌され、母体の基礎体温は高温期を維持します。しかし、妊娠5週は胎盤の形成が本格化し始める過渡期にあたり、ホルモンの分泌波に一時的な揺らぎが生じることがあります。これが、妊娠5週 基礎体温 低下 原因として最も多く見られる生理的要因です。
プロゲステロンは24時間常に一定の濃度で出続けているわけではなく、自律神経の働きや睡眠の深さ、日々の母体コンディションによって分泌リズムが微細に変化します。そのため、ホルモンの分泌量がわずかに低下したタイミングで検温すると、一時的に体温が下がったように記録されるケースがあります。
また、妊娠5週頃は子宮内膜に受精卵がしっかりと根を張り、胎嚢（赤ちゃんを包む袋）が超音波で確認できるようになる時期です。母体の循環動態が大きく変化し、熱放散や代謝バランスが再構築される過程で、体感としてほてりが和らぐことも珍しくありません。
