特大荷物ルールの運用において、特に疑問を持たれやすいのが「自由席の利用」と「ベビーカーや車椅子などの扱い」です。
◆ 自由席に特大荷物は持ち込めるか
自由席車両には特大荷物スペースつき座席の設定が存在しません。そのため、3辺合計160cmを超える荷物を携えて自由席に乗車することは原則不可となっています。自由席特急券を持っていても、特大荷物がある場合は指定席への変更手続きが必要です。
◆ ベビーカー・車椅子・楽器・スポーツ用品の扱い
ベビーカーや車椅子、楽器（ギターや大型管楽器）、スポーツ用具（ゴルフバッグ、スキー板、スノーボード、分解・折りたたみ式自転車など）は、3辺合計が160cmを超えていても特大荷物ルールの対象外（予約不要）として扱われます。
ただし、予約不要とはいえ車内の物理的スペースが増えるわけではありません。ベビーカーを畳まずに座席へ持ち込むと周囲の通行を妨げる原因になります。大型のベビーカーを畳んで安全に保管したい場合や、畳まずに快適に移動したい子連れ旅行の場合は、あえて「特大荷物スペースつき座席」を指定買いし、スペースを正当に確保する選択が推奨されます。
