生物学の王道である進化論のアプローチをとる場合、答えは極めて明確です。生物の進化史において、卵はニワトリよりも圧倒的に長い歴史を持っています。
陸上で乾燥を防ぎながら胚を育てる殻付きの卵、すなわち羊膜類の卵の起源は約3億4000万年前の古生代石炭紀にまで遡ります。恐竜や爬虫類が殻付きの卵を産み落としていた時代、当然ながら現代の鳥類やニワトリは地球上に影も形も存在していませんでした。
では、現代のニワトリに限定して時間を巻き戻すとどうなるでしょうか。家禽化されたニワトリ（学名：Gallus gallus domesticus）の直接の野生祖先は、東南アジアの森林に生息するセキショクヤケイ（赤色野鶏）であることが遺伝子解析で判明しています。
気の遠くなるような世代交代の過程で、セキショクヤケイ同士の交配時にDNAの複製ミス、すなわち遺伝子変異が発生しました。その結果、遺伝学的に「最初のニワトリ」となる受精卵が誕生したのです。この変異卵を産んだ親鳥は「ニワトリに極めて近い前駆生物」であり、卵から孵化した個体こそが正真正銘の「最初のニワトリ」でした。したがって、進化遺伝学の論理に従えば、間違いなく卵が先に存在したことになります。
