別班の実在論争を一気に決定づけたのが、2013年に共同通信社の編集委員・石井暁（いしい・ぎょう）記者が放ったスクープ記事でした。さらに石井氏は2026年、長年の取材成果をまとめた著書『自衛隊の闇組織 秘密情報部隊「別班」の正体』を上梓し、安全保障界隈に激震を走らせました。
石井記者は、元陸上幕僚長や元防衛事務次官、さらには実際に別班に所属していた複数の元幹部・元隊員からの実名・匿名証言を積み重ね、その組織構造を白日の下に晒しました。証言によって判明した事実は以下の通りです。
最大の論点となったのは、「文民統制の完全に外側に置かれていた」という事実です。歴代の首相や防衛大臣にすらその実態や具体的な活動内容が報告されておらず、陸上幕僚監部の極一部の制服組幹部によって独断で指揮・運用されていたと報じられました。海外での工作活動が万が一露見した場合、国際問題に発展するリスクを恐れた官邸幹部への「忖度」と「情報遮断（知らぬ半兵衛）」が意図的に構築されていたと見られています。
