商業施設を訪れるドライバーが最初に確認すべきポイントが、駐車料金システムと物理的な車両制限です。首都圏の大型商業施設では「最初の2時間無料、以降は館内利用額に応じて割引」というシステムが主流ですが、モラージュ菖蒲の駐車場は終日完全無料を維持しています。
敷地内には入退庫を管理するゲートバーや自動精算機、発券機は一切設置されていません。レシートをサービスカウンターへ提示して無料認証を受ける必要も一切なく、買い物の有無や滞在時間に関わらず完全フリーで入出庫できる点が、多くの利用者に支持されている大きな理由です。
敷地全体の収容台数は約5,000台を誇り、埼玉県内でも屈指のメガスケールとなっています。駐車エリアは大きく分けて「平面駐車場」「立体駐車場（P4・P5）」「本館屋上駐車場」の3系統に分かれており、それぞれ構造や使い勝手が異なります。
注意したいのが車両の高さ制限です。平面駐車場は基本的に青空駐車場のため大型のミニバンやハイルーフ車、ルーフキャリア積載車でも進入に制約はありません。しかし、立体駐車場に関しては高さ制限2.2m（一部スロープや梁下で注意喚起あり）に設定されています。一般的な国産ミニバン（アルファードやノア・ヴォクシー等）は全高2.0m未満のためそのまま進入可能ですが、大型キャリアやリフトアップを施したカスタムSUVなどは、無難に平面駐車場を選択するのが賢明です。
