忍たまキャラクターの深みは、生徒たちを温かく、時に厳しく指導する大人の存在なくしては語れない。一年は組の担任である教科担当の土井半助と、実技担当の山田伝蔵は、作品の精神的支柱だ。特に土井先生は、優しさとプロの忍者としての冷徹さを兼ね備えた屈指の人気キャラであり、孤児であるきり丸との絆は多くのファンの胸を打ってきた。
さらに、学園長の大川平次渦正の突拍子もない思いつきや、刀を抜くと人格が変わる戸部新左ヱ門、陰気ながら指導力抜群の斜堂影麿など、教員陣の個性の強さも折り紙付きだ。彼らがしっかりとした「大人の背中」を見せているからこそ、過酷な忍者の世界を描きながらも、温かみのある学園生活のストーリーが成り立っている。