一方で、高IQ者特有のメンタルヘルスの課題や社会的孤立についても見逃せない。高い知能を持つ人々は、周囲との会話のテンポが噛み合わなかったり、学校や職場での「当たり前」に馴染めず、生きづらさを感じてきた過去を持つ者が少なくない。
いわゆる「ギフテッド」と呼ばれる人々が抱える過敏性や、思考の飛躍による孤立感を和らげる場所として、メンサは重要なシェルター（避難所）の役割を果たしている。会員同士の会話では、誰も自分の思考スピードを「変人扱い」しない。この安心感こそが、多くの会員が入会後に得る最大のメリットだと口を揃える。
