取手市教委の常軌を逸した対応に対し、事態を重く見た文部科学省は2017年、地方教育行政法に基づく異例の「指導」を直接行いました。国の省庁が自治体のいじめ対応に対して直接是正を求めるのは極めて異例の事態であり、取手市の調査体制が完全に破綻していたことを証明する出来事でした。
これにより取手市の調査委員会は解散に追い込まれ、調査の主導権は茨城県教育委員会が管轄する調査委員会へと移管されました。時間をかけて丁寧な聞き取りと検証を行った結果、第三者委員会報告書は明確に結論を下しました。
報告書では、複数の同級生による日常的な無視や陰口などのいじめ行為が菜摘さんを精神的に追い詰めたと認定。「いじめが自死の主たる要因となった」と明記され、市教委および学校側の初期対応の過誤、調査手続きにおける不透明さが厳しく糾弾されました。
