手間暇かけて作った渋皮煮を長く楽しむためには、正しい保存技術が不可欠です。糖度50%以上のシロップ煮であっても、空気中の雑菌やカビ胞子が存在すると劣化が進みます。
常温で約1年間の保存を可能にするのが、「完全脱気による瓶詰め密閉法」です。耐熱ガラス瓶とフタを熱湯で5分以上煮沸消毒し、清潔な布巾の上で自然乾燥させます。熱い状態の渋皮煮と煮汁を瓶の口から1cm下まで隙間なく注ぎ、フタを「ごく軽く」締めます。この瓶を湯を張った鍋に入れ、瓶の高さの半分程度まで浸かる状態で沸騰させ、約15〜20分間加熱します。
この加熱によって瓶内部の空気が膨張して外へ押し出されます。取り出した直後に乾いた布巾などを使ってフタを限界まで固く締め、瓶を逆さまにして常温で放冷します。冷却に伴い瓶内部が強力な陰圧（真空状態）となり、フタの中央がペコッと凹めば完全脱気の成功です。冷暗所で保管すれば、翌年の秋まで風味を損なわずに保管できます。
より手軽に保存したい場合は冷凍保存が推奨されます。冷凍用密閉保存袋（ジッパー付き）に、栗が重ならないように並べ、栗が完全に浸る量のシロップと共に入れます。シロップごと凍らせることで果肉の乾燥と冷凍焼け（酸化）を完全に防ぐことができます。冷凍庫での日持ちは約6ヶ月です。解凍する際は、電子レンジを使わず冷蔵庫内で半日かけて自然解凍すると、水っぽくならず炊きたてのような食感が蘇ります。
