福岡市立南体育館の基本開館時間は午前9時から午後22時までとなっており、仕事帰りのナイトトレーニングから休日の早朝利用まで柔軟に対応しています。ただし、安全面への配慮から保護者同伴でない小中学生の利用は午後18時までと明確に定められています。休館日は原則として毎月第3月曜日（祝日の場合はその翌日）および年末年始（12月28日〜1月4日）です。
館内にはメインとなる競技場のほか、小体育室（卓球場）、武道室、弓道場、健康体力相談室、そして初心者から本格派まで対応するトレーニング室が備わっています。近年は民間フィットネスクラブの会費高騰を背景に、「月会費不要・1回ごとの都度払い」で利用できる公営体育館のトレーニング室が見直されており、福岡市立南体育館の器具充実度やコスパの高さは市民の間でも高い評価を得ています。
個人利用（個人開放）においては、競技場でのバドミントンやバスケットボール、小体育室での卓球などが定期的に割り当てられています。個人開放枠は全面貸切の大会・イベントが入っていない時間帯を中心に設定されるため、事前のスケジュール確認が不可欠です。また、定期的に開催されている各種スポーツ教室（ヨガ、ピラティス、ジュニア向け教室など）も地域コミュニティの健康づくりに大きく貢献しています。
