朝の通勤ラッシュは7時15分から8時15分頃にかけてピークを迎える。上り列車（大宮・東京・新宿方面）の4号車や7号車付近のドアは改札へ続く階段に近く便利だが、乗客が集中するため階段付近でのボトルネックが発生しやすい。少しでも人混みを避けたい場合は、車両の前後に移動して乗車するのが賢明な選択だ。
構内図の構造はきわめてシンプルで、東西を結ぶ自由通路に面した2階改札口がメインの動線となっている。改札を出て右手が東口、左手が西口だ。東口のペデストリアンデッキ下からは東武バスの各路線が発着し、スポーツ総合センターや伊奈町方面へのアクセスが容易だ。一方、西口ロータリーには西武バスや東武バスに加え、上尾市内を細かくカバーするコミュニティバス「ぐるっとくん」の乗り場が集結している。西口エリアの再開発に伴いバスターミナルへのアクセスも刷新され、雨の日でも濡れずに移動できる屋根付き通路が完備されている。
