なぜ松果体は、これほどまでに神秘主義やスピリチュアル界隈で神格化されるのでしょうか。その起源を探ると、松果体が「第三の目」と呼ばれる真相には、進化生物学的な事実と歴史的言説の交錯が存在します。
爬虫類や両生類、魚類などの下等脊椎動物には、頭頂部に直接光を感知する「頭頂眼（Parietal eye）」が存在します。これはまさに文字通りの第三の目であり、光を直接受容して生体防御や季節変化の感知に利用されています。哺乳類へと進化する過程で頭蓋骨が厚くなり、松果体は脳の深部へと埋没して直接の光受容能力を失いました。代わりに網膜からの神経伝達によって間接的に光を感知する内分泌器官へと特化していった経緯があります。
17世紀の哲学者ルネ・デカルトは、左右対称の脳の中で松果体が単一の器官として中心に位置することから、「物質（肉体）と精神（魂）が相互作用する唯一の場所＝魂の座」と仮定しました。この仮説が19世紀末の神智学運動や現代のニューエイジ思想に引用され、「松果体を覚醒させれば霊能力や第六感が開花する」という独自のオカルト文脈へと変質していったのです。
