ボニー海賊団を語る上で欠かせないもう一つの大きな疑問が、ボニー海賊団の黒ひげ襲撃とその後の顛末です。頂上戦争直後、新世界へと進出したボニーたちは、マーシャル・D・ティーチ率いる黒ひげ海賊団と激突し、船を大破された上で拘束されました。ティーチから「おれの女になるなら連れてってやる」と下卑た提案をされた際、ボニーは一切躊躇することなく「ふざけるなァ!!」とその顔面を蹴り飛ばしています。
その後、赤犬が率いる海軍の軍艦が島へ到着した際、黒ひげ海賊団は退却し、取り残されたボニー海賊団は全員が海軍の手に落ちました。当時、ネット上の考察コミュニティやSNS（旧Twitter等）では、「船員たちは海軍に処刑されたのではないか」「ギョギョたちソルベ王国の仲間は死亡したのか」という不安の声が長らく渦巻いていました。
しかし、エッグヘッド編の回想やその後の断片的な情報から、船員たちの安全な脱出と生存が強く示唆されています。政府にとって唯一の関心は「青玉鱗の被験者であり、くまをコントロールするための人質」であるボニー自身でした。元よりソルベ王国の一般市民であるギョギョたちには極刑を科す大義名分が薄く、ボニーが世界政府の厳重な監視網を掻い潜って脱走する過程で、船員たちは故郷であるソルベ王国へと送り届けられたか、あるいは地下潜伏に成功したと見られています。
事実、世界会議（レヴェリー）へボニーが単身で潜入した際、彼女の胸には「仲間たちをこれ以上危険に巻き込めない」という強い自立心と配慮がありました。ギョギョをはじめとするソルベ王国の面々は、非力な市民でありながらも、幼き日の約束を果たして彼女を新世界まで送り届けたのです。ファンコミュニティの間でも、「ギョギョたちはワンピース界で最も誇り高き大人たち」「麦わらの一味の村人たちに匹敵する無償の支援者」として、再評価の嵐が巻き起こっています。
