大玉トマトや中玉トマトでは絶大な威力を発揮する着果促進剤ですが、プチトマトの栽培では運用の見極めが求められます。知っておくべきトマトトーンミニトマト注意点として、近年のミニトマト品種は極めて単為結果性（受粉なしで結実する性質）や着果率が高く、薬剤の助けを借りずとも自然に着果するケースがほとんどである点が挙げられます。
むしろミニトマトにトマトトーンを使うと、皮が異常に硬くなったり、果実内部のゼリーが消失して食味がパサつく弊害が目立ちます。低温でどうしても花が落ちてしまう極初期を除き、ミニトマトは支柱を軽く叩いて振動受粉させるだけで十分な収穫量を得られます。
一方で、非常に相性が良いのがナス科の仲間であるナスです。トマトトーンナス使い方もトマトに準じ、開花当日から数日以内の雌しべがしっかり伸びている花に吹きかけます。希釈倍率は気温20℃未満で50倍、20℃以上で100倍と同様の基準です。ナス特有の低温着果不良や、花がポロポロと落ちてしまう「落花」を劇的に抑制し、初夏からツヤのある立派な実を連続して実らせることが可能になります。
