併用による枠の切り捨てを防ぐうえで決定打となるのが、ふるさと納税の申請手続きである「ワンストップ特例制度」と「確定申告」の性質の違いを正しく把握することです。両者は税金が軽減されるルートが根本的に異なります。
確定申告を選択すると、ふるさと納税の一部が「所得税の還付」として戻り、残りが「翌年の住民税減額」となります。所得税額が先に削られるため、所得税側の住宅ローン控除枠が余りやすくなります。一方、ワンストップ特例制度を利用した場合、所得税からの還付は発生せず、寄附金額(自己負担2,000円を除く全額)がすべて「翌年の住民税からの税額控除」として一本化されます。
このように、給与所得者で年間寄附先が5自治体以内に収まる場合は、ワンストップ特例制度を利用することで所得税の住宅借入金等特別控除枠をフル活用しやすくなります。税制上の複雑なバッティングを回避するための最もシンプルで効果的な手段です。