東京駅で初心者が最も陥りやすい罠が、運営会社の違いによる案内表記と改札口の混同です。東海道新幹線と東北新幹線乗り換え違いは、単に行き先が違うだけでなく、管轄がJR東海とJR東日本で完全に分かれている点にあります。これを取り違えると、構内を真逆の方向へ横断することになり大幅なタイムロスを余儀なくされます。
東海道・山陽新幹線（名古屋・新大阪・博多方面）はJR東海の管轄であり、案内サインは「青色（オレンジ色のJR東海ロゴ）」で表示されます。目指すべきは東海道新幹線八重洲連絡改札口（八重洲中央北のりかえ口、八重洲中央南のりかえ口、八重洲南のりかえ口など）です。
一方、東北・北海道・秋田・山形・上越・北陸新幹線（仙台・盛岡・新青森・新潟・金沢方面）はJR東日本の管轄であり、案内サインは「緑色」で統一されています。こちらは東北新幹線中央のりかえ口ルートまたは「南のりかえ口」を目指して進む必要があります。
