これほど愛されていた店舗がなぜ閉店を余儀なくされたのか。その引き金となったのは、単一店舗の業績不振ではなく、当時日本国内で吹き荒れたサブウェイの全国的な大量閉店ラッシュでした。
2010年代半ばから後半にかけ、日本サブウェイはチェーン全体のビジネスモデル転換や不採算店舗の整理、フランチャイズ契約の再編を急速に進めました。ピーク時には全国400店舗以上あったネットワークが半分近くまで縮小する激動期において、大学内テナントのような「学休期（夏休み・春休み）に客数が大きく落ち込む立地」の店舗は、契約更新のタイミングでシビアな採算性の見直しを迫られることになります。
東大工学部2号館店も例外ではなく、学内定期借家契約の満了に伴う条件見直しや、全社的な経営戦略の転換が重なった結果、惜しまれつつも契約満了による撤退という苦渋の決断が下されました。当時、閉店の知らせが学内に掲示された際には、SNS上で「工学部のオアシスが消える」「これからどこで野菜を摂ればいいのか」と悲痛な声が相次ぎました。
